Przy projektowaniu ogrzewania podłogowego należy uwzględnić odpowiednią ilość miejsca na docieplenie. Poprawna grubość warstwy izolacyjnej zabezpieczy dom przed stratą ciepła do ziemi i fundamentu. Im większa warstwa tym lepiej, jednak powszechnie stosuje się wartość co najmniej 10cm dla posadzki na gruncie, natomiast dla stropu akceptuje się wielkość przynajmniej 2,5 centymetra. Poprzez zastosowanie właściwej warstwy chroniącej ocenia się, że 85% ciepła wraca z powrotem do domu. Do izolacji podłogi wykorzystuje się płyty styropianowe typu EPS lub XPS. Pierwszy typ styropianu formują spienione granulki zgniecione w blok, który następnie dzielony jest na mniejsze tafle. Jego powierzchnia zawiera pory, co zwiększa jego nasiąkliwość. Lepszym rozwiązaniem są panele XPS, które wytwarzane są o docelowych rozmiarach. Tafle te posiadają jednorodną strukturę o płaskiej powierzchni. Ważną kwestią jest jakość płyt styropianowych, czyli ilość materiału zużyta na produkcję określonej paczki styropianu. Im większy ciężar tym cechy ochronne są lepsze. Do izolacji ogrzewania podłogowego nie stosuje się folii metalizowanej gdyż nie posiada ona cieplnych właściwości ochronnych. Wykorzystuje się ją w celu zabezpieczenia płyt styropianowych przed wodą z warstwy betonu oraz do wytyczania obszarów na przewody wodnej podłogówki.